Quando si entra nel Tempio si rimane colpiti dalle tre finestre dietro l'abside con le immagini della Vergine della Coltura, con a sinistra san Domenico e a destra san Tommaso d'Aquino. Nelle finestre delle navate laterali, comcinciando da destra, si possono ammirare il beato Innocenzo V papa, san Biagio, santa Rosa da Lima, san Giuseppe, san Giacinto. Nella navata di sinistra si possono ammirare san Pio V papa, san Luigi Gonzaga, san Martino De Porres, san Rocco, san Pietro martire.

Sulla ex cantoria è possibile ammirare san Sebastiano, san Gregorio armeno, sant'Alberto magno e san Vincenzo Ferrer.

Alle spalle delle canne organaria, sono presenti i mosaici di Cristo Re, somma Sapienza di Dio, con in mano il Libro dei Vangeli che riporta la seguente iscrizione latina, tratta dalle Sacre Scritture: "Questi è il mio Figlio prediletto". Questa vetrata, prima dei lavori di ampliamento della Basilica, faceva da sfondo al Sacro Tempio, essendo allora privo dell'abside.